這一法令從制定到推出，再到現在制定實施細則，細化管理名錄等措施，存在著很多的立法缺陷。從某種意義上說，很多惡法的制定，都是由委托立法造成的。全國人大的委托立法，由于專業(yè)性強，委托專業(yè)部門起草，難免會形成部門利益的集團保護。

　　這一法令的制定，尤其是關于產權的界定，對古生物化石的發(fā)掘、收藏、流通、科研，乃至管理，會形成許多新的弊端。要解讀《古生物化石保護條例》，就不能不說古生物化石收藏熱，還有近年來古生物化石走私大案。

　　古生物化石收藏，在國外已經有幾百年的歷史。英國達爾文的進化論，就是建立在古生物化石收藏的基礎上的。如果沒有古生物化石的收藏，就不會有十九世紀三大科學發(fā)現，更不會有自然科學的進步。

　　我國古生物化石的收藏，主要局限于地質工作者群體，近年來在收藏市場才有流通。由于國外對古生物化石收藏有幾百年的歷史，國內收藏界對古生物化石的不重視，加上高額利潤的引誘，導致了古生物化石走私猛增，而且有愈演愈烈的勢頭。如 ：2002年，美國無償返還我國93箱海關截獲的走私化石；2003年，深圳海關截獲10噸2165件未申報的化石；2004年，澳大利亞截獲了1300件，包括恐龍蛋、上古鳥類、魚類的化石；2004年，杭州海關在寧波北侖港截獲2925件化石；2006年，美國洛杉磯再次截獲42箱古生物化石，主要是恐龍蛋，大部分保存相對完好。

　　利潤，讓走私橫行。原產于我國的古生物化石，在走私的帶動下，開始了大量的盜采盜掘現象，讓古生物發(fā)掘現場遭到了嚴重的破壞，大量的科學研究信息流失。由于古生物發(fā)掘現場是不可逆的，走私與盜掘對古生物學研究帶來巨大的影響。也正因為這種現象越來越猖獗，才促使地方政府和國家部委，開始制定《古生物化石保護條例》等一系列的法規(guī)。在古生物化石追繳的過程中，為了確立行政執(zhí)法、司法審判的合法性，國家才把古生物化石產權，確立為國家所有。

　　遠古時代的漫長時間，地形地質、氣候條件的變遷，以及生物的多樣性，大自然為人類留下大量的古生物化石遺跡。古生物化石并非奇缺資源，由于未被人類所全部認識，在某些人的眼里，化石成為了稀缺物品。

　　國家制定《古生物化石管理條例》，目的在于保護古生物化石，主要是稀缺或者珍貴化石，并不是保護所有的化石。作為普通的古生物化石收藏者，在個法規(guī)中看到，古生物化石產權屬于國家，個人對于古生物化石的發(fā)掘、收藏、研究、流轉，也就失去了合法性。然而，在現實當中，古生物化石雖然屬于國家所有，但是屬于三級重點保護以外的古生物化石，在縣級以上指定單位又可以自由買賣，這和古生物化石屬于國有資產的規(guī)定相違背，而且買賣收入究竟是歸地方政府所有，還是歸中央財政所有，并沒有相關的法律規(guī)定。由于收入的指向性不明，就造成了古生物化石的流轉、所產生的收益發(fā)生混亂，這樣就會給相關的執(zhí)法部門，提供灰色收入創(chuàng)造了契機。與此同時，也產生了行業(yè)的部門壟斷，導致收藏市場價格的混亂。

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